Les génomes révèlent des lignées mondiales du psylle des agrumes.

Une étude identifie 32 variants fixes et marqueurs candidats pour retracer l'origine de Diaphorina citri.

01.09.2026 | 06h17 (UTC-3)
Cultivar Revista
Photo : Syngenta
Photo : Syngenta 

L'analyse de 133 génomes mitochondriaux de Diaphorina citri a permis d'identifier deux lignées présentant une forte différenciation génétique : l'une asiatique et l'autre américaine. L'étude a mis en évidence 32 variants nucléotidiques fixes entre les deux groupes. Ces sites peuvent servir de marqueurs moléculaires pour retracer l'origine des insectes dans le cadre des mesures de quarantaine et de surveillance.

Diaphorina citri transmet Candidatus Liberibacter asiaticus, une bactérie associée au huanglongbing. Les chercheurs ont compilé 77 génomes déjà publiés, 13 nouveaux génomes provenant du Hunan (Chine) et 43 mitogénomes obtenus à partir de données métagénomiques. L'échantillon comprenait des souches d'Asie, des Amériques et d'Afrique.

La lignée asiatique comprenait 91 échantillons, dont un provenant d'Uruguay. La lignée américaine comprenait 42 échantillons, dont un provenant du Pakistan. La différenciation entre les deux lignées atteignait un FST de 0,560, avec une valeur p inférieure à 0,001.

Dans le groupe asiatique, huit échantillons provenant du plateau du Yunnan-Guizhou ont formé un cluster génétiquement distinct. La population du plateau présentait un FST de 0,130, comparativement aux populations de plaine, ainsi qu'une diversité nucléotidique plus faible. Deux différences fixées dans les gènes trnG et rrn16 sont apparues comme marqueurs candidats pour cette lignée.

Les données suggèrent également que le sud-est de la Chine pourrait avoir été un centre d'expansion après la colonisation. La petite taille de l'échantillon en Asie du Sud-Est ne permet toutefois pas de déterminer une origine mondiale définitive.

Les scientifiques soulignent la nécessité de valider les marqueurs dans des échantillons provenant d'autres régions avant de les utiliser dans des programmes de quarantaine, de surveillance ou de gestion (doi 10.3390/insects17090917).

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