Comment les maladies du soja arrivent au Brésil

Par Erlei Melo Reis et Andrea Camargo Reis

07.03.2025 | 08h51 (UTC-3)
Photo: Paulo Santos
Photo: Paulo Santos

En 1917, Elmer Drew Merrill, conformément aux règles internationales de nomenclature botanique, a proposé que le nom scientifique correct pour le soja soit Glycinemax (L.) Merrill. Le mot Glycine, est un terme dérivé de la racine grecque Glyks, signifiant doux, probablement en allusion au tubercule sucré produit par Céleri, la plante sur laquelle Linné a basé à l'origine sa description du genre. Il a ensuite été déplacé vers un autre genre.

Aujourd'hui, la théorie la plus largement acceptée concernant le centre d'origine du soja est qu'il est apparu comme une plante domestiquée au Moyen-Orient du nord de la Chine au 2838e siècle (début de la dynastie Chou). « Le premier récit écrit sur le soja a été fait dans les livres de Pen Ts'ao Kang Mu, contenant la description de la plante par l'empereur Shen Nung, en XNUMX av. J.-C. »

En 1931, les botanistes japonais Makino et Nemoto ont été les premiers à suggérer que le soja était originaire de Mandchourie.

Le soja a été mentionné pour la première fois aux États-Unis dans une publication de 1804 de James Mease, et les premiers rapports de son introduction en Amérique du Sud remontent à 1882 au Brésil.

Aujourd’hui, la superficie cultivée en soja au Brésil s’élève à plus de 48 millions d’hectares.

Au Brésil, 40 maladies causées par des champignons, des bactéries, des nématodes et des virus sont signalées. Les principales sont causées par des champignons et des nématodes.

Les agents pathogènes qui attaquent les organes aériens du soja (feuilles, tiges et gousses) ont d’abord été signalés au Japon et en Corée (à proximité du centre d’origine), puis aux États-Unis et enfin au Brésil.

Le transport du matériel génétique du soja (graines) a propagé les agents pathogènes de la culture dans les zones où elle est actuellement cultivée. Certains agents pathogènes ont été signalés pour la première fois dans les serres d’instituts de recherche.

Les services de quarantaine des pays vers lesquels les graines de soja ont été transportées ont-ils été efficaces pour détecter et empêcher leur entrée sur les continents et dans les pays ? De plus, les programmes visant à la production et au maintien de semences libres n’ont pas été considérés comme un outil utile pour la gestion intégrée des maladies du soja ?

Une fois introduit dans les pays, et comme sa culture est très attractive pour les producteurs (prix et liquidité), le soja est cultivé en monoculture. Le vieux problème de l’érosion des sols a été presque entièrement résolu grâce à la plantation directe.

Photo de : Marcelo Madalosso
Photo de : Marcelo Madalosso

Cependant, la combinaison de ces deux pratiques – monoculture et plantation directe – contribue à la survie des phytopathogènes et à l’aggravation conséquente de l’intensité et des dommages causés par les maladies.

Concepts de base

Contrôle - « Il s’agit de l’utilisation de mesures visant à prévenir ou à réduire l’incidence/la gravité des maladies des plantes, afin d’éviter ou de réduire les dommages causés ».

Le contrôle implique l’ensemble des tactiques visant à minimiser les dommages causés par les maladies. Lorsqu’on décide de contrôler une maladie, il faut garder à l’esprit l’efficacité attendue du contrôle. Par exemple, l’objectif serait-il de réduire l’intensité de la maladie et les dommages d’environ 40, 50, 60, 70, 80, 90 ou > 90 % ?

Contrôle intégré (CI) - Selon l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO) (1968), la lutte antiparasitaire est « un système de gestion des ravageurs qui utilise toutes les techniques et méthodes appropriées, de la manière la plus compatible possible, pour maintenir les populations de ravageurs à des niveaux inférieurs à ceux qui causent des dommages économiques ».

Gestion intégrée des maladies (GIM) - un an plus tard, l'Académie nationale des sciences des États-Unis (NAS) (1969) a présenté le concept officiel de MID comme étant « l'utilisation de toutes les techniques disponibles, dans le cadre d'un programme unifié, de manière à maintenir la population d'organismes nuisibles en dessous du LDE et à minimiser les effets secondaires délétères sur l'environnement ». Le MID répond aux exigences techniques de durabilité en agriculture.

Dommage - désigne toute réduction de la quantité (kg/ha) et/ou de la qualité de la production (Nuter et al., 1993).

Perte - réduction financière (R$/ha) par unité de surface, due aux dommages (Nuter et al., 1993).

Les scientifiques concluent que la procédure la plus rationnelle est de pratiquer une gestion intégrée des maladies. Pour ce faire, il est essentiel de connaître les dégâts que la maladie provoque. Les dommages dépendent de l'ampleur de la maladie, exprimée par une fonction mathématique contenant le coefficient de dommage (Cd).

Tactiques composantes de la gestion intégrée des maladies (GIM)

Élimination de l'inoculum primaire - Les principales sources d’inoculum des agents pathogènes du soja sont les semences, les résidus de culture, les plantes volontaires, les hôtes alternatifs et les réservoirs de virus. Dans le cas des champignons du sol, ayant une capacité de compétition saprophyte, l'endroit où ils se trouvent est le sol, contenant de la matière organique végétale.

Par conséquent, dans le MID, les agents pathogènes doivent être réduits ou éliminés des sources citées.

Production et entretien de semences intactes - le centre d'origine du soja, selon Nikolaï Ivanovitch Vavilov (1887-1943), est la région de Mandchourie, en Chine. À partir de ce centre, les graines de soja ont été exportées dans le monde entier.

La principale source de graines de soja du Brésil reste les États-Unis. Cependant, il y a eu un flux important de semences de cultivars de soja transgénique RR, introduits au Brésil, d'origine argentine. L’introduction des cultivars RR d’Argentine est toujours intense.

La littérature confirme que les principales maladies des organes aériens du soja ont été décrites pour la première fois aux États-Unis, puis au Brésil. Quelques exceptions sont la cercosporiose, l'œil de grenouille, la septoriose et le mildiou, décrits pour la première fois au Japon, mais toujours en premier aux États-Unis et seulement plus tard au Brésil. On peut en déduire que la source de l’inoculum pathogène était la graine de soja introduite au Brésil. De la même manière, ils ont été et sont transportés vers les États, les municipalités et les fermes.

On peut en déduire que les agents pathogènes du soja ont accompagné la culture partout où elle est cultivée, grâce à leur association avec les graines.

Le tableau ci-dessous présente un historique d’apparition des principales maladies du soja en fonction du pays, de l’année et de l’auteur de la première description.

Historique des premiers signalements de la présence de champignons pathogènes dans les organes aériens des cultures de soja dans certains pays
Historique des premiers signalements de la présence de champignons pathogènes dans les organes aériens des cultures de soja dans certains pays

Il existe des difficultés dans la collecte de données sur la pathologie des semences de soja, en particulier dans les travaux menés au Brésil. La plupart des rapports ne font pas référence à la preuve de pathogénicité, suivant les postulats de Koch (Agrios, 2004). Elles se rapportent généralement à la description de la maladie, dans une culture ou une région, parfois polycopiés et/ou dactylographiés (rapports).

Certains agents pathogènes des cultures ne dépendent pas des semences pour être transportés vers tous les endroits où le soja sera cultivé. Dans ce cas, on inclut les champignons du sol, généralement polyphages, tels que Sclérotium rolfsii, Rhizoctonia solani, Fusarium tucumaniae, F. cuneirostrum, F. virguliforme, F. brasiliensis e Macrophomina phaseolina. Il est difficile de reconstituer l'histoire de ce groupe, d'identifier l'année et l'auteur de la description de son apparition au Brésil. Il en va de même pour Sclérotes sclérotes, qui peut être transmis aux graines sous forme de sclérotes entre elles, ou sous forme de mycélium infectieux des cotylédons.

« Dans la nature, les agents pathogènes ne se séparent pas des hôtes dont ils dépendent nutritionnellement. » « Tous les parasites nécrotrophes des organes aériens sont présents dans les graines. » Par conséquent, « dans toutes les cultures provenant de semences infectées, des taches foliaires, des chancres et de l’anthracnose apparaîtront dans les organes aériens » (Reis et Casa, 1998 ; Reis et al., 2004).

Pour produire des semences intactes, il est nécessaire de maintenir en permanence des générations de semences de fondation (petites quantités), produites en serre (RH < 70%), sans humidité foliaire (éclaboussures de pluie ou eau d'irrigation). S’il n’y a pas de cycles secondaires, les graines produites seront intactes.

Le traitement des semences de soja avec des fongicides n’est pas suffisamment efficace pour prévenir la transmission graine-cotylédons-organes aériens. Après la transmission, dans un environnement favorable, des cycles secondaires se déclenchent à partir de chaque foyer, entraînant la croissance de la maladie dans la culture.

Si la semence présente une faible incidence d’un pathogène, il faudra probablement plusieurs années de culture répétée dans la même zone (monoculture), afin de laisser le temps à l’inoculum d’augmenter et ainsi de provoquer une épidémie. Cela a dû se produire lors des premières cultures cultivées au Brésil, avec des semences provenant des États-Unis. L'inoculum est augmenté, principalement, dans les résidus de récolte, par des années successives de monoculture, dans un environnement favorable. C'est la densité de l'inoculum dans la paille qui provoque les épidémies, les dégâts et la nécessité d'un contrôle chimique. Avec une incidence élevée dans les semences, il faudra peut-être moins de récoltes en monoculture pour que la maladie atteigne le statut épidémique.

Photo : Fondation MT
Photo : Fondation MT

Dans la situation actuelle, la plupart des surfaces cultivées étant consacrées à la plantation directe et à la monoculture de soja, l’adoption de l’IDM est limitée.

Conclusions et doutes

Dans une nouvelle zone, au cours de la première année de culture, la maladie apparaît ou se manifeste dans des foyers localisés, là où la graine infectée a été positionnée. La transmission se produit et plusieurs cycles secondaires vont se succéder.

Dans la direction et l’endroit où les graines sont transportées, les agents pathogènes les suivent.

Quelles mesures ont été prises et sont prises pour empêcher l’introduction d’agents pathogènes du soja provenant d’autres pays au Brésil ? Des actions en ce sens (législation et inspection) ont-elles été menées et sont-elles efficaces ?

Par Erlei Melo Reis (Université de Buenos Aires, Institut Agris) et Andréa Camargo Reis (Institut Agris)

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