Anthracnose dans le soja semé en contre-saison

Lors des dernières récoltes, en plus de ne pas procéder à la rotation des cultures, certains agriculteurs ont cultivé du soja en contre-saison. La contre-saison désigne la deuxième saison de plantation, au cours de laquelle le maïs ou le sorgho seraient normalement cultivés.

Bien que la plus grande préoccupation technique concerne la rouille asiatique, qui a nécessité plusieurs pulvérisations, il y a eu une augmentation significative des maladies causées par des agents pathogènes nécrotrophes, avec une incidence dès les premiers stades de développement.

Plus l'inoculum initial est important, plus la probabilité d'apparition précoce de la maladie est grande, plus les dégâts causés et les coûts de lutte, qui sont généralement effectués avec l'application de fongicides, sont importants.

Parmi les différentes maladies qui surviennent dans la culture, l'anthracnose, causée par le champignon Colletotrichum truncatum, s'est produite dans différentes régions du pays, étant plus importante dans les endroits où les températures sont supérieures à 26ºC et les fortes précipitations. Les travaux menés par Klingelfuss et Yorinori (2001) démontrent que Colletotrichum truncatum était l'un des champignons nécrotrophes présents dans la plupart des échantillons de folioles et de tiges collectés au champ, même en l'absence de symptômes apparents de la maladie (plantes asymptomatiques). Pour ces auteurs, les infections latentes sont fréquentes dans ce pathosystème et la plus grande colonisation se produit initialement dans la partie inférieure des plantes, où il y a moins de soleil et plus d'humidité.

Depuis 1997, Dhingra et Acuña signalent que dans le centre du Brésil, l'incidence de l'anthracnose a considérablement augmenté, atteignant des niveaux supérieurs à 50 %.

La maladie a une distribution agrégée dans les cultures, communément appelées reboleiras, et les symptômes peuvent affecter toutes les parties de la plante, telles que les tiges, les gousses, les pétioles et les nervures des feuilles (photo 1). Les observations sur le terrain et les expériences menées par Agro Carregal suggèrent que lorsque Colletotrichum est l’agent causal de la maladie, les symptômes sont observés en au moins deux localisations distinctes (photo 2).

Les symptômes qui apparaissent exclusivement dans les cabosses et dans la superficie totale ne sont pas liés à l'anthracnose. La plante de soja peut naturellement avorter de gousses en raison de différents types de stress, qu'ils soient biotiques ou abiotiques, tels que l'incidence de maladies, de ravageurs, de stress thermique, hydrique ou même nutritionnel. Le champignon Colletotrichum peut présenter une phase saprophyte dans son cycle, se développant dans des tissus déjà lésés. Il est courant d’identifier ce champignon dans des cabosses avortées en raison d’autres types de stress. La photo 3 illustre l'évolution des symptômes de l'anthracnose dans les gousses de soja résultant d'une infection naturelle par l'agent pathogène.

La présence agrégée au champ est principalement due au type de conidie et à la propagation du champignon dans la partie aérienne de la plante. Les conidies sont produites dans des structures appelées acervula, où elles sont regroupées en une masse mucilagineuse composée de polysaccharides, de glycoprotéines et d'enzymes. Les principales fonctions de la formation des conidies dans cette structure communément appelée matrice sont la protection pour empêcher la germination prématurée des conidies, en plus de maintenir leur viabilité dans les périodes de faible humidité et de les protéger des températures extrêmes et des rayons ultraviolets.

Des recherches récentes ont vérifié l'incidence de Colletotrichum et d'autres champignons dans des échantillons prélevés sur des plantes suspectées de présenter « l'anomalie des gousses », principalement dans l'État du Mato Grosso. Les identifications ont été réalisées par des analyses morphologiques et moléculaires. Il est important de souligner qu’il n’existe pas de définition efficace de la cause de ce nouveau problème, mais différents chercheurs ont identifié l’incidence de champignons du genre Colletotrichum, Phomopsis, Fusarium e Cercospores, suggérant que ce complexe fongique serait les agents étiologiques. Cette situation à laquelle les agriculteurs ont été confrontés lors des récentes récoltes interfère encore davantage avec le rendement des cultures, augmentant ainsi les pertes.

Pour Manandhar et Hartman (1999), les pertes causées par le champignon peuvent varier d'un pays à l'autre et d'une région à l'autre ; en Thaïlande, elle est estimée entre 30 et 50 % et au Brésil, elle peut entraîner des pertes de 100 %. Les travaux réalisés à l'Université de Rio Verde (UniRV) depuis 2002 ont démontré que, dans des conditions expérimentales et avec des inoculations artificielles, les pertes relatives atteignent 10 à 20 %, soit des pertes de 14 à XNUMX sc/ha.

Selon Silva et al. (2013), l'anthracnose nécessite l'adoption de plusieurs pratiques de lutte, telles que le traitement des semences (évite l'introduction de nouvelles races), une fertilisation équilibrée (le potassium a joué un rôle important dans la réduction des symptômes), la rotation des cultures (réduction de l'inoculum initial), l'utilisation de moins de cultivars sensibles et lutte chimique. Sur le terrain, la principale alternative adoptée par les producteurs repose sur l'utilisation de fongicides.

Selon les principales recommandations, la lutte chimique doit être débutée de manière préventive avant même la floraison ou dès la détection des premiers symptômes (Silva et al., 2013). De nos jours, les applications 25 à 30 jours après la levée sont plus efficaces. Mais, comme c'est le cas pour tout être vivant, les processus naturels d'évolution provoquent une variabilité génétique du pathogène et la pression de sélection exercée par l'utilisation constante et erronée de fongicides peut sélectionner des individus naturellement résistants.

Les résultats publiés par Rogerio et al (2022) ont montré des mutations dans le champignon Colletotrichum truncatum pour la résistance multiple aux fongicides appartenant aux groupes chimiques des strobilurines (mutation G143A) et des benzimidazoles (mutations E198A et F200Y). Pour ces auteurs, les groupes chimiques des triazoles et des carboxamides se sont révélés efficaces dans le contrôle in vitro des isolats testés. Les expériences de terrain réalisées à Agro Carregal jusqu'à la récolte 2022/23 corroborent les résultats publiés par Rogerio et al (2022).

Dans les expériences in vitro réalisées chez Agro Carregal, parmi les triazoles testés, les produits contenant du difénoconazole, du propiconazole et de l'époxiconazole se sont révélés les plus efficaces. Parmi les carboxamides évalués, le benzovindiflupyr s'est également distingué par sa grande efficacité de contrôle (photo 4). Il est important de souligner que dans ces expériences, certains principes actifs n'ont pas été testés dans des conditions in vitro, comme les triazoles méfentrifluconazole, flutriafol et tétraconazole ; et les carboxamides bixafène, pidiflumetofem, impirfluxam et fluindapyr.

Pour gérer efficacement la maladie, l’agriculteur doit toujours consulter un agronome et se tenir au courant d’informations de qualité.

Par Luís Henrique Carregal, Recherche Agro Carregal et Protection des Plantes

Article publié dans le numéro 291 de la revue Cultivar Grandes Culturas